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特定の塩基配列を検出し，細胞分裂時に中間期にＤＮＡが２倍量に増えるのと同じように，ＤＮＡの特定領域をＤＮＡポリメラーゼで増やすことができる。これを連続して，30回程度行わせることでＤＮＡは100万倍にも増えると言われている。今日では高温耐性菌から発見されたＤＮＡポリメラーゼが用いられており，高温でも変性しにくいため，連続した反応を続けることが出来るようになった。 |
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今日の親子鑑定をはじめとする個人の特定，各種遺伝病の診断，生物の系統分析に広く用いられている。シークエンサーで塩基配列を調べることができる時代ではあるが，簡便に塩基置換や欠失，挿入を調べることができる。 |
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その過程を以下に，簡単に示す。 |
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(1) |
「熱変性」約95℃：ＤＮＡの二重らせん構造の塩基間の水素結合を熱運動で切り，１本鎖ＤＮＡにする過程 |
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(2) |
「アニーリング」約60℃：ＤＮＡの２重らせん間の水素結合が再び回復する温度。ＤＮＡ複製の開始点を決める人工合成したプライマーを高濃度に与えることで，もとの各１本鎖同士が戻る前に，特定部分にプライマーが結合する。 |
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(3) |
「伸長反応」約75℃，ＤＮＡポリメラーゼの最適温度である。プライマーを開始点として，ヌクレオチドの伸長反応が起こる。この温度変化を25〜40回繰り返す。高温耐性菌由来の酵素であるため，熱変性しにくい。むしろ初めに98℃のように高い温度を与えることで，ある構造をとり安定化し，活性の上がるものもある。 |
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